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核酸檢測(cè)技術(shù)“上新”較傳統(tǒng)方法漏判、誤判率更低

來(lái)源:科技日?qǐng)?bào)   發(fā)布時(shí)間:2022-02-24 17:11:14

   數(shù)字PCR技術(shù)靈敏度高、可精準(zhǔn)定量。那些多次采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方式進(jìn)行核酸檢測(cè),結(jié)果卻為陰性的病毒攜帶者,利用數(shù)字PCR技術(shù)就能準(zhǔn)確地檢測(cè)出他們是陽(yáng)性患者。

  ◎本報(bào)記者 華 凌

  春節(jié)前后,國(guó)內(nèi)外新冠肺炎疫情仍在持續(xù)。當(dāng)前肆虐的奧密克戎毒株,雖然引發(fā)的癥狀相對(duì)較輕,但其基因突變位點(diǎn)多,傳播速度快,不易被發(fā)現(xiàn),在多地成散發(fā)態(tài)勢(shì)。因此,針對(duì)奧密克戎的核酸檢測(cè)試劑,靈敏度要非常高。

  近日,由清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系教授郭永團(tuán)隊(duì)與北京新羿生物科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱(chēng)新羿生物)等多家單位,采用數(shù)字PCR技術(shù)聯(lián)合研發(fā)的新型冠狀病毒核酸檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法),正式獲得國(guó)家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)醫(yī)療器械批文。

  據(jù)悉,這是NMPA首個(gè)基于數(shù)字PCR技術(shù)的新冠檢測(cè)試劑批文。該試劑盒也是全球首個(gè)經(jīng)評(píng)審后正式獲批的將數(shù)字PCR技術(shù)運(yùn)用于感染性疾病領(lǐng)域的檢測(cè)產(chǎn)品。這意味著,在與新冠病毒的“戰(zhàn)斗”中,人類(lèi)有了更精準(zhǔn)的病毒檢測(cè)“神器”。

  數(shù)字PCR技術(shù)是核酸檢測(cè)的標(biāo)尺

  2020年,新冠肺炎疫情暴發(fā)初期,核酸檢測(cè)試劑盒缺乏、患者確診困難等難題亟待解決,郭永敏銳地覺(jué)察到,由于新冠病毒低病毒載量樣本的存在,對(duì)于高靈敏度的核酸檢測(cè)有著迫切需求。靈敏度不夠或定量不準(zhǔn)確,都可能會(huì)影響樣本陰陽(yáng)性的判讀,造成漏判或誤判。

  “PCR即聚合酶鏈反應(yīng),是一種在生物體外進(jìn)行脫氧核糖核酸(DNA)復(fù)制的技術(shù)手段,它可以將生物體中含量微小的遺傳物質(zhì)如核酸分子等復(fù)制擴(kuò)增為原有數(shù)量的近百億倍,從而實(shí)現(xiàn)核酸分子的超敏檢測(cè)和精準(zhǔn)定量。”郭永介紹。

  得益于PCR技術(shù),無(wú)論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前的案件中嫌疑人所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點(diǎn)的DNA,就能用PCR技術(shù)加以放大,進(jìn)行比對(duì)。自20世紀(jì)80年代問(wèn)世以來(lái),PCR技術(shù)幾經(jīng)更迭,到目前實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)已成為臨床上分子診斷的主打技術(shù)。

  然而,由于qPCR技術(shù)需要大體積反應(yīng)系統(tǒng),存在較多的背景干擾,且無(wú)法獲得絕對(duì)定量結(jié)果。隨著臨床檢測(cè)要求的提高,qPCR技術(shù)不能滿足臨床一些超高靈敏度、高精密度的檢測(cè)要求,臨床上急需新的檢測(cè)技術(shù)。為此,近10年來(lái),被稱(chēng)為“第三代PCR技術(shù)”的數(shù)字PCR技術(shù)開(kāi)始迅速發(fā)展。

  郭永介紹,“數(shù)字PCR技術(shù)的原理,就是把一份反應(yīng)液樣本,分散成幾萬(wàn)個(gè)極微小的液滴,每個(gè)小液滴所在的反應(yīng)單元都包含零個(gè)、一個(gè)或多個(gè)拷貝的目標(biāo)核酸分子,這些小液滴同時(shí)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,最后通過(guò)計(jì)算熒光液滴數(shù)目,就可以計(jì)算出原來(lái)的反應(yīng)液當(dāng)中有多少個(gè)目標(biāo)核酸分子的拷貝數(shù)目了。”

  郭永指出,“靈敏度高、可精準(zhǔn)定量這兩大優(yōu)勢(shì)讓數(shù)字PCR技術(shù)在傳統(tǒng)方法難當(dāng)重任時(shí)可‘挺身而出’,特別是在新冠病毒的核酸檢測(cè)中,那些多次采用qPCR技術(shù)方式進(jìn)行核酸檢測(cè),結(jié)果卻為陰性的病毒攜帶者,數(shù)字PCR技術(shù)卻能準(zhǔn)確地檢測(cè)出他們是陽(yáng)性患者。從這個(gè)意義上來(lái)說(shuō),數(shù)字PCR技術(shù)可謂是核酸檢測(cè)的標(biāo)尺。”

  “此次獲批上市的新冠病毒檢測(cè)數(shù)字PCR試劑盒,是在之前qPCR技術(shù)即第二代PCR技術(shù)的基礎(chǔ)上,借助微流控生物芯片,數(shù)字化顯示新冠病毒的拷貝數(shù),極大地提升了核酸檢測(cè)的‘信噪比’。其靈敏度可達(dá)100拷貝/毫升。”郭永表示。

  新羿生物聯(lián)合創(chuàng)始人楊文軍博士說(shuō),在實(shí)際應(yīng)用中,這個(gè)試劑盒有效提高了檢測(cè)靈敏度,可以降低陽(yáng)性漏檢情況。此外,這個(gè)“嗅覺(jué)”靈敏的“新冠探測(cè)器”對(duì)包括德?tīng)査旰蛫W密克戎株等在內(nèi)的目前全球范圍內(nèi)常見(jiàn)的15種變異株,均不會(huì)出現(xiàn)漏檢和脫靶。哪怕是樣本中僅有微量的新冠病毒,也難逃它的法眼。“數(shù)字PCR技術(shù)為新冠肺炎疫情防控與核酸檢測(cè)提供了更精準(zhǔn)的利器。”楊文軍說(shuō)。

  目前,數(shù)字PCR新冠檢測(cè)試劑盒已進(jìn)入商務(wù)部抗疫出口物資白名單。

  國(guó)內(nèi)企業(yè)開(kāi)啟全鏈條式自主研發(fā)

  數(shù)字PCR技術(shù)是生命科學(xué)和臨床診斷的關(guān)鍵技術(shù),更是核酸檢測(cè)領(lǐng)域的上游技術(shù),以前我國(guó)一直依靠國(guó)外引進(jìn)。

  近年來(lái),國(guó)內(nèi)誕生的十余家數(shù)字PCR研發(fā)企業(yè)使這個(gè)市場(chǎng)迸發(fā)出新的生命力,以新羿生物為代表的一批新銳企業(yè)異軍崛起,包括領(lǐng)航基因科技(杭州)有限公司(以下簡(jiǎn)稱(chēng)領(lǐng)航基因)、蘇州銳訊生物科技有限公司、思納福醫(yī)療科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱(chēng)思納福醫(yī)療)等在內(nèi)的數(shù)字PCR研發(fā)企業(yè)也開(kāi)始與國(guó)外企業(yè)同臺(tái)競(jìng)技,大力推進(jìn)數(shù)字PCR技術(shù)及其產(chǎn)品的國(guó)產(chǎn)化進(jìn)程,打破了進(jìn)口壟斷。

  2019年1月7日,浙江省藥品監(jiān)督管理局正式批準(zhǔn)領(lǐng)航基因的生物芯片閱讀儀iScanner 5上市。該產(chǎn)品是領(lǐng)航基因繼2018年6月獲批國(guó)內(nèi)首款擁有完全獨(dú)立自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的固態(tài)芯片式數(shù)字PCR儀之后,推出的全新五色熒光液滴數(shù)字PCR系統(tǒng),大幅提升了數(shù)字PCR的多色熒光技術(shù)水平。此次獲批,標(biāo)志著我國(guó)數(shù)字PCR臨床轉(zhuǎn)化走在了國(guó)際前列。

  2020年,思納福醫(yī)療推出了全自動(dòng)化數(shù)字PCR產(chǎn)品,這是首款國(guó)產(chǎn)一體化數(shù)字PCR儀,也是全球第三款上市的全自動(dòng)化數(shù)字PCR產(chǎn)品,該產(chǎn)品將我國(guó)數(shù)字PCR技術(shù)提升到了國(guó)際頂尖水平。

  “只有與專(zhuān)業(yè)團(tuán)隊(duì)強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合,通過(guò)自主研發(fā)將核心技術(shù)掌握在自己手里,才能在激烈競(jìng)爭(zhēng)中掌握主動(dòng)權(quán)。”楊文軍表示,新羿生物與清華大學(xué)等聯(lián)合研發(fā)的數(shù)字PCR系統(tǒng)從核心原材料、芯片、儀器、軟件到臨床檢測(cè)試劑,整個(gè)檢測(cè)鏈條的各個(gè)環(huán)節(jié),均為自主研發(fā)成果。

  據(jù)介紹,該團(tuán)隊(duì)研發(fā)的數(shù)字PCR系統(tǒng)包含樣本制備儀和生物芯片分析儀,一次可以完成96個(gè)樣本的檢測(cè),且無(wú)須手工移液,樣本擴(kuò)增完成后,直接放入生物芯片分析儀中,即可進(jìn)行信號(hào)讀取與分析。這兩款產(chǎn)品分別于2017年、2019年獲批。同時(shí),針對(duì)不同病癥和用途,團(tuán)隊(duì)還研發(fā)了不同的檢測(cè)試劑,通過(guò)“儀器+試劑”相互配合的方式,打出數(shù)字PCR檢測(cè)的“組合拳”,目前已開(kāi)發(fā)出20多種檢測(cè)試劑。

  將在重大疾病檢測(cè)上發(fā)揮作用

  “實(shí)際上,感染性疾病正是數(shù)字PCR技術(shù)應(yīng)用的一大理想場(chǎng)景,它可用于新冠肺炎、乙肝、結(jié)核、艾滋病等比較重大的感染性疾病的早期和快速診斷。此外,數(shù)字PCR技術(shù)還可在腫瘤基因檢測(cè)、無(wú)創(chuàng)出生缺陷篩查兩大應(yīng)用場(chǎng)景中發(fā)揮用武之地。”楊文軍介紹。

  比如,我國(guó)肺癌病人基數(shù)比較龐大,且治療藥物也較多,患者的用藥與其基因檢測(cè)結(jié)果直接相關(guān),傳統(tǒng)切片需要取樣后再做病理診斷,現(xiàn)在血液檢測(cè)取樣會(huì)更方便,而且數(shù)字PCR設(shè)備的檢測(cè)靈敏度也更高。

  “至于無(wú)創(chuàng)出生缺陷篩查,以往更多依賴基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)行。”楊文軍說(shuō),“而且基因測(cè)序主要是在大城市的大醫(yī)院進(jìn)行,到小城市推廣相對(duì)困難,而數(shù)字PCR設(shè)備操作簡(jiǎn)單、成本更低,市場(chǎng)下沉更有優(yōu)勢(shì)。”

  據(jù)了解,基于數(shù)字PCR技術(shù),我國(guó)已在腫瘤、出生缺陷和重大感染性疾病診斷方面開(kāi)發(fā)了一系列新型分子診斷產(chǎn)品。

  楊文軍表示:“今后對(duì)于這三大臨床應(yīng)用領(lǐng)域,這些產(chǎn)品會(huì)涵蓋一線需求,解決一些行業(yè)痛點(diǎn)。”

責(zé)任編輯:邢敏