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北大農(nóng)研院全球首次成功構(gòu)建西瓜屬超級(jí)泛基因組圖譜

來源:濰坊新聞網(wǎng)   發(fā)布時(shí)間:2024-07-09 08:13:00

  

  濰坊日?qǐng)?bào)社濰坊融媒訊 7月8日,市政府新聞辦在北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院召開新聞發(fā)布會(huì),介紹北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院暨濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室全球首次成功構(gòu)建西瓜屬超級(jí)泛基因組圖譜重大成果相關(guān)情況并回答記者提問。

  7月8日,北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院、濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室在國際頂尖期刊《自然-遺傳學(xué)》上在線發(fā)表了題為Telomere-to-telomere Citrullus Super-pangenome Provides Direction for Watermelon Breeding的研究成果,標(biāo)志著我國在全球農(nóng)業(yè)遺傳學(xué)研究領(lǐng)域走在了前列。

  西瓜是世界重要的園藝經(jīng)濟(jì)作物之一,西瓜全球年產(chǎn)量接近1億噸,我國生產(chǎn)和消費(fèi)了全球總量的60%以上,是西瓜第一大國,同時(shí)我國也是世界上西瓜種質(zhì)創(chuàng)新和品種選育最為活躍的國家。但隨著氣候變化的加劇和病蟲危害的日益嚴(yán)重,西瓜育種面臨著遺傳多樣性變狹窄,抗病耐逆基因大量丟失等嚴(yán)重挑戰(zhàn)。

  西瓜屬超級(jí)泛基因組圖譜的成功構(gòu)建,繪制了西瓜屬全部7個(gè)種的28份代表性材料的端粒到端粒高質(zhì)量基因組圖譜,成功構(gòu)建首個(gè)屬級(jí)端到端超級(jí)泛基因組。該項(xiàng)研究拓展了西瓜屬的分類系統(tǒng),核實(shí)了西瓜起源的理論依據(jù),鑒定出461,987個(gè)結(jié)構(gòu)變異(SV),并利用野生西瓜的基因組序列和抗病基因信息,確定了西瓜抗枯萎病生理小種1的候選基因。同時(shí),還為西瓜精準(zhǔn)分子設(shè)計(jì)育種提供了最高質(zhì)量最全面的參考基因組,有助于更加快速準(zhǔn)確地建立基因與性狀的一一對(duì)應(yīng)關(guān)系和開發(fā)育種技術(shù)。該項(xiàng)研究揭示了西瓜屬的基因組演化歷史,發(fā)掘了西瓜野生種中豐富的遺傳多樣性,提供了利用野生種質(zhì)創(chuàng)制優(yōu)異育種材料的新范例,為其他作物超級(jí)泛基因組的構(gòu)建和野生種質(zhì)的利用指明了方向。

  北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院、濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室已全面開啟基于多組學(xué)的西瓜精準(zhǔn)分子設(shè)計(jì)育種4.0,育成西瓜新品種7個(gè),申請(qǐng)植物新品種權(quán)7個(gè),這些品種已在全國25個(gè)省、市、地區(qū)示范推廣。下步,該院還將利用本次研究成果,擴(kuò)展西瓜基因資源庫,增強(qiáng)抗病育種,更高效地進(jìn)行基因組選擇和精確育種、深入開展分子育種、推動(dòng)優(yōu)質(zhì)西瓜新品種選育,提升育種效率,并積極與國內(nèi)外研究機(jī)構(gòu)合作繼續(xù)挖掘基因資源,推動(dòng)西瓜種質(zhì)創(chuàng)新,促進(jìn)西瓜產(chǎn)業(yè)的綠色高質(zhì)量發(fā)展。

  發(fā)布會(huì)上還舉行了科技成果轉(zhuǎn)化集中簽約儀式,6家企業(yè)與北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院、濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室簽訂了合作意向協(xié)議。

  濰坊日?qǐng)?bào)社全媒體記者: 于哲/文 尹寧/視頻

責(zé)任編輯:邢敏

一審:邢敏 二審:李倩 三審:李中偉